สิ่งที่ต้องปกป้องให้พ้นจากเงื้อมมือของพวกมันและก็มนุษย์คืออะไรกันแน่!? ข่าวคราวการพบเจอ ‘มนุษย์กลายร่างลึกลับ’ ถูกส่งมาถึง U-NASA สถานที่คือ ป่าลึกบนคาบสมุทรยูกาตัน ทวีปอเมริกากลาง ที่ซึ่งมีโบราณสถานอารยธรรมมายา ทีมสกาเวนเจอร์สซึ่งประกอบด้วยทาจิบานะ โทเฮย์ กับอลิซาเบธ รูนี่ย์ที่เป็นผู้เข้า รับการผ่าตัด M.O. แต่ผลลัพธ์ออกมาไม่สมบูรณ์ ได้รับคำสั่งให้ไปทำการสำรวจ พื้นที่ดังกล่าว นอกจากพวกเขาแล้วก็มีสมาชิกคนอื่นอีก ได้แก่ โคโนะ ไคกิที่มาเป็น หัวหน้าทีม กับชีล่า อเล็กซ์ และมาร์กอสที่เป็นคนพื้นถิ่นของแกรนด์เม็กซิโกซึ่งเป็น สถานที่ที่จะไปสำรวจในครั้งนี้!! พวกโทเฮย์มุ่งหน้าไปที่หมายซึ่งเป็นโบราณสถาน ทว่าสิ่งที่รอพวกเขากลับเป็นพวก เทราฟอร์เมอร์ดัดแปลงซึ่งใช้การผ่าตัด M.O. ที่หลากหลายอันเป็นมรดกชั่วร้ายของ ยามาบะ!! ณ ปลายทางของการต่อสู้อันดุเดือด สิ่งที่คู่ควรแก่การปกป้องคือ...!?