สัมผัสของจูบที่ยังหลงเหลือชวนให้เคลิบเคลิ้มขณะก้าวเข้าสู่เทอมใหม่ และ "พายุ" ฤดูใบไม้ร่วงที่กำลังมาเยือน...!? เมื่อใดมีแสงสว่างเมื่อนั้นก็ย่อมมีเงา พระจันทร์ที่ซ่อนเร้นอยู่หลังกลุ่มเมฆ รักที่เปรียบดั่งพายุดอกไม้— หากกล่าวเช่นนั้น คงจะช่วยให้เข้าถึงเรื่องราวได้ง่ายขึ้น นาโนฮะกับจิโดริที่ข้ามผ่าน "พายุ" มาได้ พร้อมกับสายสัมพันธ์ที่แน่นแฟ้นขึ้น ในขณะที่ทั้งคู่ซึ่งไม่ประสีประสา ยังคงรู้สึกประหม่ากับเรื่องราวที่ผ่านมา ก็ต้องเตรียมรับมือกับอีเวนต์ถัดไป นั่นคือ งานวัฒนธรรม... และแล้ว——— ในที่สุด "ความลับ" ของทั้งสองคนก็...!?