ร้านขนมแห่งความลับคือเรื่องราวของ อุเมโมโตะ เคียวโกะ (ชื่อเล่น อันจัง) เริ่มทำงานที่ร้านวากาชิ “มิตสึยะ” ในชั้นใต้ดินของห้างสรรพสินค้าแห่งหนึ่งเธอเป็นเด็กสาวร่าง (ติดจะ) ท้วม วัยสิบแปดปีแต่ละวันของเธอรายล้อมไปด้วยผู้จัดการร้านและเพื่อนร่วมงานที่แม้จะเป็นมืออาชีพ แต่ก็มีเอกลักษณ์เฉพาะตัวไม่มีใคร เหมือนร้านแห่งนี้ทำให้เธอเริ่มรู้ซึ้งถึงเสน่ห์ของวากาชิ (ขนมญี่ปุ่นแบบดั้งเดิม) ซึ่งเต็มไปด้วยเรื่องราวและลูกเล่นต่างๆ รวมถึงความจริงอันคาดไม่ถึงที่ซุกซ่อนอยู่ในคำพูดและการกระทำมากปริศนาของคุณลูกค้าแต่ละคน นี่คือนิยายสืบสวนที่รับรองได้เลยว่าอ่านแล้วต้องเผลอตัววิ่งไปร้านขายขนมแน่นอน