ประเทศเอกราชยามาโตะได้ทุ่มกำลังทั้งหมดเข้าจู่โจมกองเรือที่ 3 แห่งอเมริกา โดยต้องการให้มันพินาศจนหมดสิ้น ยังไงก็ตามยามาโตะซึ่งใช้อาวุธธรรมดาเข้าปะทะกับกองเรือที่ 3 แห่งอเมริกา ก็จมดิ่งลงสู่ทะเลลึกพร้อมกับอาวุธนิวเคลียร์ที่อยู่ภายใน ทว่าในขณะเดียวกันนั้น... รัฐบาลญี่ปุ่นที่ได้ลงมติร่วมเป็นพันธมิตรกับยามาโตะก็ได้มอบหน้าที่ให้กับสภาความมั่นคงแห่งสหประชาชาติเป็นผู้ดูแลเรื่องนี้ไป