จิโดริที่ล่วงรู้ความในใจของรุ่นน้องอย่าง ไม ที่มีต่อ นาโนฮะ จนก่อเกิดมรสุมขึ้นภายในจิตใจ— เมื่อใดมีแสงสว่างเมื่อนั้นก็ย่อมมีเงา พระจันทร์ที่ซ่อนเร้นอยู่หลังกลุ่มเมฆ รักที่เปรียบดั่งพายุดอกไม้— หากกล่าวเช่นนั้น คงจะช่วยให้เข้าถึงเรื่องราวได้ง่ายขึ้น หลังผ่านพ้นการทะเลาะครั้งใหญ่ระหว่างทัศนศึกษามาได้ สายสัมพันธ์ของจิโดริกับนาโนฮะก็กลับมาแน่นแฟ้นยิ่งขึ้น ในขณะที่อีกด้าน ไม รุ่นน้องและเพื่อนสมัยเด็กที่มีใจให้กับนาโนฮะ ยังคงตกอยู่ในห้วงคำนึงที่บีบเค้นหัวใจไปในแต่ละวัน และในตอนนั้นเอง ไมก็เผลอบอกความในใจของตนออกไป ให้จิโดริรับรู้โดยไม่ได้ตั้งใจ…!? พายุระลอกใหม่ถือกำเนิดขึ้นในหัวใจอีกครั้ง—