วาคาบะเด็กสาวม.ต้นธรรมดาได้รับสืบทอดบ้านทรงยุโรปขนาดใหญ่จากคุณทวดที่นั่นวาคายะได้พบกับสาวน้อยปริศนาที่ถูกปิดผนึกวิญญาณไว้ในห้องใต้ดินเมื่อสาวน้อยผู้เรียกตัวเองว่า "หนูน้อยหมวกแดง" ได้รับการปลดปล่อยวาคาบะก็ถูกดึงเข้าไปผัวพันในการต่อสู้ของเหล่าแม่มดที่ดำเนินสืบเนื่องมาตั้งแต่สมัยโบราณพวกวาคาบะต่างทุ่มเทให้กับภารกิจของ "จอมเวทย์สมุดมนตรา" ที่ต้องปกป้องผู้คนแต่จอมเวทย์ขององค์กรปริศนาที่ชื่อว่า "เกเซลซาฟท์" ก็ปรากฏตัวขึ้นมาอย่างกะทันหันและต้องการผูกมัดทั้งสองคนหนูน้อยหมวกแดงอาละวาดเปิดศึกกับพวกเขาโดยไม่ฟังเสียงห้ามปรามของวาคาบะทว่าจอมเวทย์ของ "เกเซลซาฟท์" มีพลังที่เหนือเกินกว่าจินตนาการจนทำให้หนูน้อยหมวกแดงอยู่ในสภาพที่เป็นตายเท่ากันสายพันธ์ของทั้งสองจะเป็นเช่ไรต่อไป...