ชายคนหนึ่งเสียชีวิตด้วยเหตุการณ์ประหลาด โดยมีรูโหว่บนร่างและลอยค้างกลางอากาศในย่านชินจูกุ แปดปีต่อมาอาราคาวะ โยโดมิ ลูกชายของผู้เคราะห์ร้ายคนนั้น เจอกล่องพัสดุที่ส่งถึงพ่อในวันธรรมดาวันหนึ่งที่เขา ทำกิจวัตรตามปกติ เมื่อโยโดมิเปิดกล่องก็วูบหมดสติ ไปก่อนจะลืมตาขึ้นมาพบหัวกะโหลกพูดได้พร้อมกับรับรู้ว่า ตนได้รับพลังที่สามารถเปลี่ยนเป็น "สเกเลตัน (มนุษย์ล่องหน)" แบบไม่มีสาเหตุ "ฉันทำให้พ่อของนายตาย"...คำพูด ของหัวกะโหลกที่แนะนำตัวเองว่าชื่อยามาโมโตะนั้น ทำให้เวลาที่หยุดชะงักไปของเด็กหนุ่มเดินต่ออีกครั้ง